Sorry, ich war in den letzten Tagen unterwegs.

Schätzte ein Hash-Vergleich oder Stichproben auf Byte-Ebene helfen da wenig

Ja, das hatten wir uns am Anfang auch gedacht. :-)
Die Datenbank besteht aus mehreren Indizes, die jeweils einen Ordner belegen. Die Ordner enthalten die Dateien mit den Daten. Diese werden aber nicht 1:1 genau gleich erstellt. Daher helfen weder File-Vergleiche noch Hashes oder ähnliches auf Datei-Ebene.
Ich habe alles durchprobiert. Leider blieb uns nur noch diese Möglichkeit.
Ein Gutes hat es aber: Ich habe wieder sehr viel über den Code und die Prozeduren beim Replay und bei der Ablage der Daten im block_log und im block_log.index gelernt. :-)

Wie groß ist eigentlich die DB zur Zeit?

Das hängt ja im Wesentlichen von den aktivierten Plugins ab. Ein Zeugenknoten hat mit block_log derzeit etwa 400 GB, ohne block_log nur etwa 30 GB. Der Account-History-Knoten hat insgesamt schon 850 GB.